วันหนึ่ง ซากุระโคจิ ซากุระ ขณะอยู่บนรถโดยสาร ได้เห็นชายหนุ่มเผาร่างคนอื่นด้วยเปลวไฟสีฟ้าและได้สบตากับชายคนนั้น เมื่อเธอแจ้งตำรวจและกลับไปที่เกิดเหตุก็ไม่ได้พบศพหรือหลักฐาน ต่อมาเธอได้พบฆาตกรนั้นอีกครั้ง ในฐานะนักเรียนที่เพิ่งย้ายมาที่ใช้ชื่อว่า "โอกามิ เรย์"
    โอกามิ เป็นหนึ่งใน Code Breaker ที่ไร้ตัวตน ท่าทางราวกับนักฆ่าเลือดเย็น แต่ด้านซากุระโคจิแทนที่จะหวาดกลัว กลับพยายามเปลี่ยนความคิดของเขาว่าการฆ่าไม่ใช่สิ่งที่ถูกต้อง เธอได้พบความจริงว่าโอกามิเป็น Code: Breaker รหัส 06 เป็นสมาชิกลับในองค์กรที่ทำงานให้กับรัฐบาล